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三階段純化策略
純化問題所涉及的具體步驟zui終取決于樣品的性質(zhì)。但也有共同可參考的階段
捕獲階段:目標(biāo)是澄清、濃縮和穩(wěn)定目標(biāo)蛋白。
中度純化階段:目標(biāo)是除去大多數(shù)大量雜質(zhì),如其它蛋白、核酸、內(nèi)毒素和病毒等。
精制階段:除去殘余的痕量雜質(zhì)和必須去除的雜質(zhì)。
分離方法的選擇
根據(jù)蛋白質(zhì)的特殊性質(zhì)采用不同的分離方法:
蛋白質(zhì)的性質(zhì) | 方法 |
電荷(等電點) | 離子交換(IEX) |
分子量 | 凝膠過濾(GF) |
疏水性 | 疏水(HIC)反相(RPC) |
特異性結(jié)合 | 親和(AC) |
每一種方法都有分辨率、處理量、速度和回收率之間的平衡。
分辨率:由選擇的方法和層析介質(zhì)生成窄峰的能力來實現(xiàn)。總的來說,當(dāng)雜質(zhì)和目標(biāo)蛋白性質(zhì)相似時,在純化的zui后階段分辨率是重要因素。
處理量:一般指在純化過程中目標(biāo)蛋白的上樣量。如上樣體積、濃度等。
速度:在初純化中是重要因素,此時雜質(zhì)如蛋白酶必須盡快除去。
回收率:隨著純化的進行漸趨重要,因為純化產(chǎn)物的價值在增加。
在三階段純化策略中每一種方法的適用性見下表:
技術(shù) | 主要特點 | 捕獲 | 中度純化 | 精制 | 樣品起始狀態(tài) | 樣品zui終狀態(tài) |
IEX | 高分辨率 高容量 高速度 | ★★★ | ★★★ | ★★★ | 低離子強度 樣品體積不限 | 高離子強度或pH改變。 樣品濃縮 |
HIC | 分辨率好 容量好 高速度 | ★★ | ★★★ | ★ | 高離子強度 樣品體積不限 | 低離子強度 樣品濃縮 |
AC | 高分辨率 高容量 高速度 | ★★★ | ★★★ | ★★ | 結(jié)合條件特殊 樣品體積不限 | 洗脫條件特殊 樣品濃縮 |
GF | 高分辨率 (使用Supedex) | ★ | ★★★ | 樣品體積(<總柱體積的5%)和流速范圍有限制 | 緩沖液更換(如果需要) 樣品稀釋 | |
RPC | 高分辨率 | ★ | ★★★ | 需要有機溶劑 | 在有機溶劑中,有損失生物活性的風(fēng)險 |
提示:
1、通過組和各種方法使純化步驟之間的樣品處理減至zui少,以避免需要調(diào)節(jié)樣品。*個步驟的產(chǎn)物的洗脫條件應(yīng)適宜于下一個步驟的起始條件。
2、硫酸銨沉淀是常用的樣品澄清和濃縮方法,所以HIC是捕獲階段的理想方法。
3、GF很適宜在由濃縮效應(yīng)的方法(IEX、HIC、AC)后使用,凝膠過濾對上樣體積有限制,但不受緩沖液條件的影響。
4、在捕獲階段選擇對目標(biāo)蛋白具有zui高選擇性或/和處理量的方法
5、如果對目標(biāo)蛋白的性質(zhì)了解甚少的情況下,可采用IEX-HIC-GF的方法組合作為標(biāo)準(zhǔn)方案。
6、只要目標(biāo)蛋白耐受的情況下,可以考慮采用RPC方法用于精制階段。
注:應(yīng)該指出,三階段純化策略不是說所有的策略都必須是三個純化步驟。所用的步驟數(shù)目取決于純度要求和蛋白的zui終用途。
附:純化工藝路線
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