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定量蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)研究的前沿學(xué)科。目前常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)有熒光差異凝膠電泳(DIGE)、同位素親和標(biāo)記(ICAT)等。同位素標(biāo)記相對(duì)和定量(iTRAQ)技術(shù)是近年來開發(fā)的一種新的蛋白質(zhì)組學(xué)定量研究技術(shù)。結(jié)合非凝膠串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù),該技術(shù)可對(duì)復(fù)雜樣本、細(xì)胞器、細(xì)胞裂解液等樣本進(jìn)行相對(duì)和定量研究,具有較好的定量效果、較高的重復(fù)性,并可對(duì)多達(dá)8種不同樣本同時(shí)進(jìn)行定量分析。
蛋白質(zhì)組學(xué)的研究非常復(fù)雜,僅僅知道蛋白質(zhì)的身份并不足以zui終確定蛋白質(zhì),因?yàn)榈鞍踪|(zhì)的濃度對(duì)于實(shí)現(xiàn)其在細(xì)胞中的功能來說極其重要,一種特殊蛋白質(zhì)在濃度上的變化,就能預(yù)示細(xì)胞的突變過程。因此,科學(xué)家能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)的相對(duì)和濃度進(jìn)行測(cè)量,是很重要的事情。過去,科學(xué)家通常*行二維(2D)凝膠電泳,切斷條帶,再用質(zhì)譜方法測(cè)量條帶中的蛋白質(zhì)。而采用iTRAQ蛋白質(zhì)定量技術(shù)可以加速蛋白質(zhì)的定量研究,基于高度靈敏性和準(zhǔn)確性的串聯(lián)質(zhì)譜方法,不需要凝膠,就可以獲得蛋白質(zhì)相對(duì)和的結(jié)果。iTRAQ試劑盒包括8種同量的氨基反應(yīng)試劑,能對(duì)蛋白質(zhì)水解的肽段標(biāo)記,因此采用串聯(lián)質(zhì)譜方法,可以對(duì)肽段進(jìn)行準(zhǔn)確的鑒定和定量。iTRAQ的操作程序非常簡(jiǎn)單,既可以直接標(biāo)記蛋白質(zhì),也可以將蛋白質(zhì)酶解為肽段,然后用iTRAQ試劑進(jìn)行差異標(biāo)記。再將標(biāo)記物混合,這樣就可以對(duì)其進(jìn)行比較。與樣本結(jié)合后,用2D液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行分析。在質(zhì)譜分析鑒定特殊肽離子片段結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上采用Protein Pilot軟件包對(duì)每一個(gè)肽段進(jìn)行鑒定。
技術(shù)路線圖:
iTRAQ定量實(shí)驗(yàn),操作簡(jiǎn)便沒有更多煩瑣的額外操作步驟,相對(duì)于一般的蛋白質(zhì)組分析流程,iTRAQ定量只增加了簡(jiǎn)單的一步,iTRAQ標(biāo)記,反應(yīng)效率高、時(shí)間短,不會(huì)增加工作量。只要掌握了一般的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù),就能完成iTRAQ定量實(shí)驗(yàn)。
主要特點(diǎn):
1、一次實(shí)驗(yàn)同時(shí)定量4或8個(gè)樣品,極大提高了通量。
2、技術(shù)路線簡(jiǎn)單,不需要額外的煩瑣操作。
3、能夠增強(qiáng)二級(jí)碎片離子信號(hào),能產(chǎn)生更好的y離子和b離子系列,二級(jí)譜圖質(zhì)量更好。
4、標(biāo)記所有的肽段,提高了蛋白質(zhì)組的覆蓋率,包括翻譯后修飾,而且提高了鑒定和定量的可信度。
由于iTRAQ定量實(shí)驗(yàn)具有操作簡(jiǎn)單、重復(fù)性好、定量效果好等特點(diǎn),所以得到大家的認(rèn)同和喜愛,并且逐漸成為蛋白質(zhì)組學(xué)定量研究技術(shù)的主流。
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