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基因組序列的迅速獲得推動了一門新興學科——功能基因組學的發(fā)展,這一學科重點關注基因功能的變化。擴增性片段長度多態(tài)性(Amplified restriction fragment length polymorphism,AFLP)分析以及反向遺傳學都是功能基因組學的重要組成部分。
傳統(tǒng)的反向遺傳學,例如用轉座子(transposon)敲除特定基因,雖然可以準確測定表型,但需要進行耗時的轉基因或復雜的組織培養(yǎng)。而且由于這種基因敲除的方法將整個基因敲除,無法觀察到活性基因功能部分缺失的結果。
為克服此基因敲除方法的局限性,進一步獲得關于活性基因突變的信息,F(xiàn)red Hutchinson癌癥研究中心的研究者們發(fā)明了一種定向誘導基因組局部突變(TILLING: Targeting Induced Local Lesions In Genomes)技術。該方法具有簡單的特點,它利用化學突變方法來獲得所有基因的傳統(tǒng)的點突變等位基因系列。對那些表型分析時會牽涉到亞致死等位基因的重要基因,TILLING的方法具有其*的優(yōu)勢。隨著TILLING方法有效應用到越來越多的生物種類,如果蠅,擬南芥,斑馬魚,玉米等,它在遺傳學研究方面的重要價值也越發(fā)體現(xiàn)出來。
但由于點突變一般很難被檢測出來,一直是TILLING技術應用上的一個障礙。要得到好的結果,要求檢測儀器不僅靈敏度高,還能夠識別假陽性位點。我們在這兒給大家引薦一種更簡便,靈敏,準確的高通量TILLING分析技術:雙色紅外熒光檢測技術。
雙色紅外熒光檢測技術是美國LI-COR公司的技術。LI-COR長期致力于此項技術在生物學研究中的應用,他們開發(fā)的Odyssey雙色熒光掃描系統(tǒng)及DNA遺傳分析系統(tǒng)都取得了很大成功。由于雜質、干擾分子在紅外區(qū)幾乎不發(fā)光,用紅外熒光進行檢測的背景非常低,靈敏度很高,可檢測到低達1moles的熒光分子。加上雙通道檢測(680nm激發(fā),710nm檢測;780nm激發(fā),820nm檢測),兩個通道檢測波長相距110nm,相對于通常的可見熒光四色檢測來說,幾乎沒有光譜重疊的干擾(見下圖),保證了TILLING分析中每一個突變堿基的準確識別及整個檢測的靈敏度。
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