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上海士鋒生物科技有限公司
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質粒的提取和制備

時間:2016-2-22閱讀:901
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溶液配制

(一)lb培養基
每1000 mL加分析純NaCl 10 g,蛋白胨10 g,酵母粉5 g,用ddH2O配制,再用10 M NaOH調pH至7.4(100 mL一般加450 µL),高溫高壓蒸汽滅菌15 min冷卻后使用。
固體培養基加入瓊脂1.5%。
10 M(或N)NaOH配制方法是稱200 g NaOH加300 mL,攪拌充分溶解后定容至500 mL。
(二)溶液Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ
溶液Ⅰ:葡萄糖50 mmol/L,EDTA 10 mmol/L,Tris-HCl 25 mmol/L,pH至8.0。可一次配制100 mL,在1.05 kg/cm2高溫高壓蒸汽滅菌15 min,4℃保存。
溶液Ⅱ:NaOH 0.2 mol/L(從10 N NaOH中現用稀釋),SDS 1%,用現配現用。
溶液Ⅲ:取5 mol/L乙酸鉀 60 mL,冰乙酸11.5 mL,混合后ddH2O至100 mL。保存于4℃,用時置于冰浴中。
1 M Tris-HCl(pH 7.5)配制方法:Tris(MW 12.1)12.1 g 加濃HCl(MW 36.5)72 mL,調節pH到7.5并定容到1000 mL。1 M Tris-HCl(pH 8.0)配制方法:12.1 g Tris加800 mL ddH2O,用HCl(~42 mL)調pH到8.0。等溶液在室溫下冷卻,zui后調節pH到8.0并定容到1000 mL。高溫高壓蒸汽滅菌。
(三)酚-氯仿-異戊醇(25:24:1)
按25:24:1的比例混勻平衡酚、氯仿、異戊醇,保存于棕色玻璃瓶中,上覆一層Tris-Cl水相,4℃保存備用。酚-氯仿-異戊醇混合物在100 mmol/L Tris-Cl(pH 8.0)緩沖液下在不透光的瓶中可保存一個月之久。
(四)TE(pH 8.0)
10 mM Tris-HCl(pH 8.0),1 mM EDTA(pH 8.0),加ddH2O至1000 mL。高溫高壓蒸汽滅菌。或用100×TE母液稀釋。
(五)STE
10 mM Tris-HCl(pH 8.0),0.1 M NaOH,1 mM EDTA(pH 8.0),加ddH2O至1000 mL。高溫高壓蒸汽滅菌。

小提質粒(堿裂解法)

1、從平板上挑取單菌落或搖甘油菌(5~50 µL),接種于3 mL的LB液體培養基中(加于相應的抗生素),37℃振蕩培養至OD600大于2.0,無需過夜。
通常DH菌株搖12~16 hr;JM101搖7~8 hr;ER2566搖10~12 hr。
2、取1.5 mL的菌液于1.5 mL的Eppendorf管(可取未滅菌的新管)中,12000 rpm離心30 sec,棄上清。通常取1.5 mL的菌液再離心一次,棄上清后在紙上扣干。不要忘記將用完的試管及管蓋放入處以備回收處理。
3、加入100 µL溶液Ⅰ振蕩使菌體沉淀充分懸浮,務必懸浮充分。
4、加入200 µL溶液Ⅱ,立即輕輕翻轉幾下,使菌體裂解。可觀察到原渾濁的菌懸浮液變清變粘。
5、加入150 µL溶液Ⅲ,立即上下顛倒充分混勻7-10次,不宜太劇烈。可觀察到白色片狀沉淀出現。
6、置冰浴10 min,也可置于-20℃中5 min。
7、12000 rpm離心8~10 min。
8、在離心過程中可取未滅菌的新1.5 mL的Eppendorf管,加入等體積(350~400 µL即可)酚-氯仿-異戊醇(25:24:1)備用,取滅菌的新1.5 mL的Eppendorf管,加入2倍體積(780 µL體積即可)的無水乙醇于-20℃備用。加酚-氯仿-異戊醇時要小心,應吸位于下層的酚相,而不要帶入上層的Tris-Cl保護液。
9、離心完將上清迅速倒入已加的酚-氯仿-異戊醇中,充分混勻。小心不要將白色沉淀物倒入酚-氯仿-異戊醇中。
10、12000 rpm離心4~5 min。
11、吸水相,加入已加好的無水乙醇中,顛倒混勻幾次。小心不要吸入酚相,沒把握時寧可放棄一些水相。

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