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本公司專業經銷代理elisa檢測試劑盒,進口試劑,近日,我司實驗室經常接到客戶這樣的疑問,他們在測試大腸桿菌轉化子時,大腸桿菌轉化子有大有小,結果詭異,想咨詢一下具體原因。
這情況我遇到過,尤其菌液PCR時候,有的強有的弱,有的帶大小還不一樣。我沒有具體研究過啥愿意,但把大小一樣的那個送去測序,一般都是正確的。
關于你的這個情況,我分析【我自己的我也分析過】
1、可能酶產物碎了一些,這樣連進去就有大有小。如果你引物用的是在載體上的,那很可能擴出大小不同的。如果你引物就是在基因上的,這個好解決,你把退火溫度逐漸提高,看看是不是那個不同片段就沒了。
2、有的時候發生了片段自連【這個看起來好像很可笑,但其實我發現只要末端有一個堿基配對,時間長的話,片段是可以連接到一起的,這個就跟TA連接實際一樣】。
3、你的電泳系統有污染,你把別人的片段給收進去了,這個我確實證實過,我一批克隆40個基因,我曾經在別的克隆中挑出過另外的基因。
4、另一種可能,你T載體上連接的方向問題,如果酶切不*,可能同樣會造成不同大小片段,這些如果你量很多的話其實在跑電泳回收時候是分不開的,但PCR趕巧了,也許就正好擴出來了【這種情況只限于載體上有你用的酶切位點,而你目的片段上恰恰引入了這連個酶,這個你可以試著畫個圖看看,把TA連接的正反畫畫】。
5、DH好像能長很大的,也沒關系的,我的有時候就很大點,其實不用放室溫,你冰箱4-8℃那層放置1個月,就看出來了。
6、所以我覺得這個問題也沒法糾結了。如果你覺得切割實在很難,那干脆重新PCR從T載體上擴出來【高保真擴一般也不會突變,當然TAKARA的primerstar除外】,帶上酶切位點,然后直接回收酶切連接就可以了,找到重組子后測序正確在表達就行了不是。
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