elisa檢測試劑盒有了基因組序列，Baker等研究人員能夠鑒定出同時進化的氨基酸，即時它們在未折疊的鏈上彼此不相鄰。這些事件表明，這些氨基酸在折疊蛋白質中是鄰居，為研究人員研究蛋白結構提供了線索。結構上的接近可以提示功能關系，以及自然選擇在功能上的作用。
在蛋白質家族數據庫Pfam中有接近15,000個蛋白質家族。對于近三分之一的家族，每個家族中至少有一種已通過實驗確定其結構的蛋白質。對于另三分之一的家族，可根據一定程度的置信度建立比較模型。然而，對于另外5211個蛋白家族，目前沒有任何結構信息。
研究人員確定了建模所需的序列數量，開發出模型質量的標準，并且在可能的情況下，將預測的接觸與已知結構進行匹配來改進建模。這種方法預測出614個蛋白質家族的結構模型，其中約140個帶有PDB中未出現的折疊。這種方法提供了大蛋白家族的代表性模型，向著蛋白質結構計劃的目標邁進了一大步。
elisa檢測試劑盒JGI的Nikos Kyrpides表示，Baker實驗室與JGI之間的合作讓團隊提出了一個強大的方法來預測結構和結構比對。“正如預期的那樣，當我們增加了宏基因組學數據，利用我們數據庫中50億個組裝好的宏基因組序列，我們能夠明顯增加許多已知蛋白家族的覆蓋。”
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