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客戶提供
基因序列或蛋白質(zhì)氨基酸序列
zui終交付
約4 μg含有目的片段的高純度凍干質(zhì)粒DNA;
含有重組質(zhì)粒的穿刺菌一管;
發(fā)貨文件主要包括如下內(nèi)容:測(cè)序結(jié)果、COA報(bào)告、sqd文件。
備注:默認(rèn)合成克隆基因至pUC57載體
鄭重承諾:對(duì)客戶提供的核酸/氨基酸序列或基因合成的結(jié)果沒有所有權(quán),并承諾對(duì)結(jié)果嚴(yán)格保密,且不會(huì)以任何形式散布到第三方。
載體選擇主要考慮下述3點(diǎn):
1、構(gòu)建DNA重組體的目的,克隆擴(kuò)增/表達(dá)表達(dá),選擇合適的克隆載體/表達(dá)載體。
2、載體的類型:
(1)克隆載體的克隆能力-據(jù)克隆片段大小(大選大,小選?。S绕鋵?duì)于病毒載體來說,載體包裝容量的大小是評(píng)估能否成功包裝病毒的首要因素。
①腺病毒可以插入長(zhǎng)約8kb的外源基因。目前,我們包裝過長(zhǎng)度為7.5kb外源基因的腺病毒。
②慢病毒的包裝容量約為6kb(包含載體帶有的其他抗性基因或報(bào)告基因),但是2kb以上的外源基因包裝慢病毒難度就增加了,增大1kb會(huì)下降1個(gè)單位數(shù)量級(jí)的滴度,故2kb以上的基因包裝慢病毒需要進(jìn)行評(píng)估。此外,毒性蛋白、凋亡蛋白和膜蛋白(作為受體、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白行使功能)等由于其本身的功能,包裝可能會(huì)有一定難度。
③AAV的總包裝容量是4.7 kb(包含載體中兩個(gè)ITR約0.3kb +具體啟動(dòng)子 + 內(nèi)含子約0.6kb + 具體熒光標(biāo)簽 + polyA約0.2kb),所以插入目的基因一般約2kb 左右。由于AAV包裝容量有限,目的基因大于2kb,可考慮去除內(nèi)含子,因?yàn)閮?nèi)含子只是有助于插入的目的基因穩(wěn)定表達(dá)。
(2)確定表達(dá)蛋白的目的,然后再來選擇優(yōu)勢(shì)的表達(dá)質(zhì)粒。一般分為原核表達(dá)和真核表達(dá)質(zhì)粒,前者主要用于體外純化蛋白,如帶His-tag的PET系列,帶GST-Tag的PGEX系列,選用不同的表達(dá)載體,就得建立相應(yīng)的純化系統(tǒng),包括緩沖液的配置、珠子/柱子的選擇等等,還得考慮目的蛋白的可溶性,一般大tag的融合蛋白可溶性要好一些,如GST的。這種原核純化的蛋白一般用來制備單一的、需要量大的蛋白。真核表達(dá)載體一般是細(xì)胞、體內(nèi)表達(dá)等需要時(shí)所用,只需要將它放到細(xì)胞或體內(nèi)細(xì)胞即可,唯1考慮的是它的啟動(dòng)子的選擇,常用都是cmv啟動(dòng)子的,表達(dá)效率較高,也有多種啟動(dòng)子經(jīng)過改造的表達(dá)載體,一般用來表達(dá)需要調(diào)控表達(dá)時(shí)間及表達(dá)量的蛋白。
3、載體MCS中的酶切位點(diǎn)數(shù)與組成方向因載體不同而異,適應(yīng)目的基因與載體易于連接,不產(chǎn)生閱讀框架錯(cuò)位。
①選分子量小的質(zhì)粒,即小載體(1-1.5kb)→不易損壞,在細(xì)菌里面拷貝數(shù)也多(也有大載體);
②一般使用松弛型質(zhì)粒在細(xì)菌里擴(kuò)增不受約束,一般10個(gè)以上的拷貝,而嚴(yán)謹(jǐn)型質(zhì)粒<10個(gè);
③必需具備一個(gè)以上的酶切位點(diǎn),有選擇的余地;
④必需有易檢測(cè)的標(biāo)記,多是抗生素的抗性基因。
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