標(biāo)準(zhǔn)菌株
亦稱模式菌株，在給某細(xì)菌定名，分類作記載和發(fā)表時(shí)，為了使定名準(zhǔn)確和作為分類概念的準(zhǔn)則，以純粹活菌（可繁殖）狀態(tài)所保存的菌種。相當(dāng)于動(dòng)植物分類中的模式標(biāo)本。在進(jìn)行細(xì)菌等的分類和鑒定時(shí)，生理學(xué)和生物化學(xué)特性十分重要，但若就這些性質(zhì)進(jìn)行試驗(yàn)，就必須應(yīng)用許多純分離的新細(xì)胞。

因此，作為分類標(biāo)準(zhǔn)的菌種，也有必要進(jìn)行純粹分離，并以活菌（可以分裂）狀態(tài)保存。在標(biāo)準(zhǔn)菌種中，對于從作過原始記載的作者實(shí)際分離或應(yīng)用的菌株，通過營養(yǎng)繁殖獲得和保存的菌株，稱為正標(biāo)準(zhǔn)菌株。此外，當(dāng)原作者使用復(fù)數(shù)菌株，以后的研究者選擇其中之一作為最shi當(dāng)?shù)木陼r(shí)，稱該菌種為選定標(biāo)準(zhǔn)菌株。

當(dāng)原作者使用的菌株失掉，以后的研究者就新的菌株研究，記載后，確認(rèn)可以作為國際上正標(biāo)準(zhǔn)菌株的代替菌株時(shí)，稱該菌株為新模式菌株。保存菌種時(shí)，必須留心不使菌株在保存過程中死亡或發(fā)生變異。最chang用的保存方法是凍結(jié)干燥法。模式菌株應(yīng)由適當(dāng)?shù)木N保存機(jī)構(gòu)保存。

派生菌株
從技術(shù)角度來講，標(biāo)準(zhǔn)菌株都是從國家認(rèn)可的機(jī)構(gòu)或者國外菌種保藏機(jī)構(gòu)購買得到的，為0代菌種的凍干粉，在使用前需要進(jìn)行復(fù)蘇、傳代、鑒定和保藏等工作，并且在使用前需要提前一天進(jìn)行活化，需要梯度稀釋后對其進(jìn)行計(jì)數(shù)定量。

而商業(yè)派生菌株則是由標(biāo)準(zhǔn)菌株派生出來的，通常為凍干形式，一般是3~5代菌種，它的特點(diǎn)是不需要進(jìn)行活化、傳代、鑒定和保藏，即得即用，無需進(jìn)行提前活化和梯度稀釋，按照廠家提供的說明書操作即可得到所需數(shù)量的菌液，大大節(jié)省了微生物實(shí)驗(yàn)室工作人員的工作負(fù)擔(dān)。

從文件管理方面來講，使用標(biāo)準(zhǔn)菌株時(shí)，從標(biāo)準(zhǔn)菌株到標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備菌株，再到工作菌株，這一系列的使用過程均應(yīng)有相應(yīng)的程序文件和記錄，相關(guān)的人員一定要進(jìn)行必要的培訓(xùn)，具備齊全的培訓(xùn)記錄；而使用商業(yè)派生菌株則只需要由生產(chǎn)廠家提供質(zhì)檢報(bào)告和溯源性報(bào)告，保證其與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效，同時(shí)保證其可溯源性。

除此之外，與商業(yè)派生菌株相比，標(biāo)準(zhǔn)菌株的使用過程中對于硬件設(shè)施及耗材的投入相對較大，成本也并不比商業(yè)派生菌株低。

在微生物檢驗(yàn)領(lǐng)域，商業(yè)派生菌株的應(yīng)用范圍和標(biāo)準(zhǔn)菌株并無明顯區(qū)別，可用于藥檢中的靈敏度試驗(yàn)、促生長試驗(yàn)、無菌檢查、培養(yǎng)基適用性檢查、控制菌檢查等；食品檢驗(yàn)的定量、定性對照、培養(yǎng)基質(zhì)控等；化妝品微生物檢驗(yàn)質(zhì)量控制。

質(zhì)控菌株

本質(zhì)上是標(biāo)準(zhǔn)菌株的商業(yè)衍生產(chǎn)品，其應(yīng)有可靠的溯源證明追溯至其使用的標(biāo)準(zhǔn)菌株來源，在微生物實(shí)驗(yàn)室僅可作為工作菌株進(jìn)行使用，在使用前也應(yīng)進(jìn)行特性和純度的確認(rèn)。
質(zhì)控菌種基本上分為兩類：

第一種滿足低濃度接種量的要求，細(xì)菌含量一般小于100cfu，這是各種微生物培養(yǎng)基促生長試驗(yàn)、微生物陽性對照試驗(yàn)的接種量要求，無菌工藝模擬試驗(yàn)中培養(yǎng)基的靈敏度檢測、無菌或微生物限度檢查實(shí)驗(yàn)方法驗(yàn)證等。

為了滿足高濃度接種的需要，其他種類的細(xì)菌含量一般為105-106cfu。是對防腐劑、抑菌劑、消毒劑等抗菌活性物質(zhì)功效的試驗(yàn)或挑戰(zhàn)性試驗(yàn)。這種實(shí)驗(yàn)對對數(shù)滴的微生物有統(tǒng)計(jì)要求，因此需要相對高濃度的細(xì)菌溶液。

質(zhì)控菌種的優(yōu)勢：
1、精確的CFU已知應(yīng)變個(gè)數(shù)降低實(shí)驗(yàn)失敗率
這個(gè)優(yōu)勢真的很棒。實(shí)驗(yàn)室至少需要3-6個(gè)月的時(shí)間，才能建立穩(wěn)定的各種菌株的稀釋定量方法。培養(yǎng)人員有效實(shí)施該方法需要3個(gè)月的時(shí)間。購買菌株的原始情況不同。即使同一菌株、同一復(fù)蘇方法、培養(yǎng)條件、培養(yǎng)時(shí)間、同一稀釋方法各不相同，但稀釋的細(xì)菌數(shù)量仍不相同。

每一個(gè)微生物實(shí)驗(yàn)室必須在同一天對供試品進(jìn)行稀釋和添加后，發(fā)現(xiàn)第二天的計(jì)數(shù)結(jié)果超標(biāo)，或第二天在冰箱中取出的菌液中的菌株全部死亡，沒有陽性反應(yīng)，這些實(shí)驗(yàn)都需要重做，如果是原料試驗(yàn)或成品試驗(yàn)，很難解釋，因此質(zhì)量控制菌菌株的穩(wěn)定、定量特性對實(shí)驗(yàn)室具有重要意義，大大提高了微生物實(shí)驗(yàn)的成功率。

2、質(zhì)控菌種的CFU數(shù)量穩(wěn)定，減少了樣品之間的差異
這在各種微生物檢驗(yàn)中非常有用，因?yàn)樾枰獙Ω鞣N樣品進(jìn)行比較。如果加菌量相差較小，則評價(jià)結(jié)果更為準(zhǔn)確。例如，試驗(yàn)樣品陽性的實(shí)際添加量為10 CFU，陽性對照的實(shí)際添加量為90 CFU。雖然它們都滿足<100cfu的要求，但終微生物生長的判斷會(huì)帶來一些問題。
如果只看無菌試驗(yàn)中菌株的生長情況，可能對弱生長和好生長有不同的判斷，也可能影響定量試驗(yàn)的回收率。但如果我們使用質(zhì)控菌種，我們可以更準(zhǔn)確地判斷結(jié)果，避免此類問題。

3、大大縮短實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備時(shí)間，使用方便，降低成本
傳統(tǒng)的菌種實(shí)驗(yàn)需要經(jīng)過菌種回收、培養(yǎng)、稀釋等過程，還需要準(zhǔn)備培養(yǎng)基和消耗品配合實(shí)驗(yàn)。例如，黑曲霉的培養(yǎng)需要5-7天，加上實(shí)驗(yàn)，至少在制備前7天。
但質(zhì)控菌種實(shí)驗(yàn)只需要無菌水和具有一定無菌操作能力的人員加上使用移液槍的能力普通實(shí)驗(yàn)室人員可以勝任對實(shí)驗(yàn)中難以控制的菌株如銅綠假單胞菌和黑曲霉的控制。另一方面，也可以降低人員成本。