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進(jìn)口TSZ ELISA試劑盒反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù)
復(fù)性溫度和時間:復(fù)性溫度決定聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特異性,合適的復(fù)性溫度應(yīng)低于引物Tm值的5℃。退火溫度過低,引起非特異性擴(kuò)增;增高退火溫度,可提高擴(kuò)增的特異性,因此要嚴(yán)格規(guī)定退火溫度。退火反應(yīng)時間一般為1min。
在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)開始的頭一次循環(huán)時,反應(yīng)從遠(yuǎn)低于Tm值的溫度開溫,由于Taq酶在低溫時仍具有活性,這時就可能因引物與模板非特異性配對面出現(xiàn)非特異性產(chǎn)物或出現(xiàn)引物二聚體 然后在以后整個聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)中,非特異性產(chǎn)物反復(fù)擴(kuò)增,而使聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)嚴(yán)重失敗。為了盡量消除這種非特異性擴(kuò)增,可以使用熱起動的方式,熱起動方法有幾種:一種方法是在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)系統(tǒng)中加入抗Taq酶抗體。抗體與Taq酶結(jié)合,使Taq酶活性受抑制。因此在開始時,雖然溫度低,引物可與與模板錯配,但因Taq酶沒有活性,不會引起非特異性擴(kuò)增;當(dāng)進(jìn)行熱變性時,抗體在高溫時失活,Taq酶被釋放,就可發(fā)揮作用,在以后的延伸步驟進(jìn)行特異的DNA聚合反應(yīng)。另一種熱起動法是用石蠟將Taq酶與聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)系統(tǒng)分隔,因此一開始在室溫條件下也沒有非特異性擴(kuò)增。當(dāng)升溫到熱變性溫度下,石蠟熔化,Taq酶與聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反面系統(tǒng)混合,從而在以后的步驟中發(fā)揮作用。使用熱起動可以提高聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增的特異性。
延伸溫度與時間:延伸溫度一般為72℃左右,此時Taq酶活性為每秒鐘摻入核苷酸35-100個,2kb的片段用1min已足夠,若DNA段較長,擴(kuò)增時間可適當(dāng)延長。延伸時間過長又可引起非特異性擴(kuò)增。
循環(huán)次數(shù):循環(huán)次數(shù)主要取決于初靶分子的濃度,例如在初始靶分子為3x10^5、1.5x10^4、1x10^3和50拷貝數(shù)時,循環(huán)數(shù)可分別為25-30、30-35、35-40從40-45。過多的循環(huán)次數(shù)會增加非特異性產(chǎn)物量及堿基錯配數(shù)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)后期,擴(kuò)增產(chǎn)物的增加并不成為指數(shù)方式,稱為平臺效應(yīng)。平臺效應(yīng)可能與下列因素有關(guān):dNTP與引物濃度降低,酶對模板的比例相對降低,多次循環(huán)后酶活力降低,產(chǎn)物濃度增高后變性不*而影響引物延伸。
變性溫度與時間:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)中變性這一步很重要,若不能使模板DNA和聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)產(chǎn)物*變性,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)就不能成功,DNA分子中G+C含量愈多,要求的變性溫度愈高。太高的變性溫度和時間又會影響Taq酶的活性,通常的變性溫度和時間分別為95℃、30s,有時用97℃、15s。雖然DNA鏈在變性溫度時兩鏈分離只需幾秒鐘,但反應(yīng)管內(nèi)部達(dá)到所需溫度還需要一定的時間,團(tuán)此要適當(dāng)延長時間。為了保證模板DNA能*變性為7-10min,然后在以后的循環(huán)中,將變性步驟設(shè)為95℃/min。擴(kuò)增100-300bp短片段時,還呵以用快速的兩步聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法,即變性(94-97℃)、退火及延長(55-75℃)。為防止在變性溫度時反應(yīng)液的蒸發(fā),可在反應(yīng)管內(nèi)加入1-2滴液體石蠟。
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