一、當選擇一個肽用于免疫原，什么是重要的？
答：通常蛋白的C端或N端是蛋白質中暴露機會zui高的部分。另外，為了模仿蛋白的行為，合成的肽應該有類似于蛋白質“cut out off”后的結構和電荷。因此：
1. 來源于C端的多肽那么N端應用乙酰化修飾；
2. 來源于N端的多肽那么C端應用酰胺化修飾；
3. 來源于內部序列的多肽則需要肽的兩端都修飾。
二、什么樣的抗原(s)可以用于注射？
答：天然蛋白，重組蛋白，多肽碳水化合物或其他微生物、細菌、病毒提取物可用于免疫接種，需要大小為5-10 kDa的小分子誘導充分的免疫反應，有生物毒害的材料禁止用于免疫接種。上海恒遠提示：
1. 如果抗體作用于變性的靶標蛋白，變性的抗原是。
2. 如果使用的抗體的目標蛋白質是天然蛋白，非變性的抗原是。
3. 并不是所有anti-peptide抗體都能識別天然蛋白質，因此謹慎選擇肽序列是至關重要的。
4. 通過重組蛋白在細菌表達體系誘導所制備的抗體在某些情況下無法識別天然蛋白質。原因可能是在細菌細胞中表達的蛋白質抗原發生錯誤的折疊。不能保證用于任何的免疫反應中都能得到很好的成功。
三、用于免疫接種的抗原需要多少量？
答：這取決于抗原的免疫原性。在標準試驗方案中，我們使用：大約500μg肽/動物/15周齡，約400μg蛋白質/動物/15周齡。
如果所選動物抗原和抗體之間的關聯性較低，免疫接種時較少量的抗原(少于10μg)也是可以接受的。我們還可以使用自己的免疫方案。上海恒遠提醒注意：如果蛋白質需要濃縮，在某些情況下，在濃縮設備中蛋白會部分附著在膜上從而部分蛋白質損失。
四、為什么抗原誘導反應只會產生一些IgM抗體？
答：由于缺乏T細胞刺激，高度保守的哺乳動物蛋白質的響應往往很薄弱，主要導致IgM抗體的產生，不過，也有例外。如果是保守的哺乳動物抗原，則使用親源關系遠的物種。
